Do początku roku 1945 Gębice Gubińskie były mijanką na linii dwutorowej. Mijanka pozwalała tylko i wyłącznie na wyprzedzanie pociągów jadących w tym samym kierunku. Dodatkowo znajdowała się tu ładownia i tylko ona przetrwała rozbiórkę infrastruktury przez wojska sowieckie w 1945 roku. Obecnie tor szlakowy i ładunkowy w okolicy przystanku jest porozkręcany i kompletnie niezdatny do eksploatacji. Nastawnia dysponująca znajdowała się w budynku dworca, nastawnia wykonawcza położona była od strony stacji Guben.